调查立案程序违法，可申请复议或提起诉讼。依据《刑事诉讼法》等，立案程序需合法，否则影响证据有效性和程序正义。不及时处理可能导致冤假错案，损害当事人权益。
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立案程序违法需纠正。具体操作：1. 收集证据，证明程序违法；2. 向立案机关或其上级申请复议，说明违法点；3. 若复议无果，向法院提起行政诉讼，要求撤销或变更原决定；4. 必要时，可寻求律师帮助，确保权益得到充分保护。
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调查立案程序违法，常见处理方式为申请行政复议或提起行政诉讼。选择时需考虑违法性质、影响程度及自身诉求，行政复议适用于行政内部纠错，诉讼则通过司法途径解决。